| 排名 | 球员 | 球队 | 进球数 | 点球数 |
| 1 | 大黑将志 | 京都不死鸟 | 26 | 5 |
| 2 | 韦林顿 | 湘南比马 | 20 | 2 |
| 3 | 船山贵之 | 松本山雅 | 19 | 4 |
| 4 | 纳扎里斯 | FC歧阜 | 17 | 2 |
| 4 | 前田辽一 | 磐田喜悦 | 17 | 2 |
| 6 | 池元友树 | 北九州向日葵 | 15 | 3 |
| 7 | 冈田翔平 | 湘南比马 | 14 | 0 |
| 8 | 都仓贤 | 札幌冈萨多 | 14 | 1 |
| 9 | 迭戈.德索萨 | 山形山神 | 14 | 2 |
| 9 | 洛维尼奥 | 群马草津温泉 | 14 | 2 |
| 11 | 肯佩斯 | 千叶市原 | 13 | 1 |
| 11 | 河原和寿 | FC爱媛 | 13 | 1 |
| 13 | 难波宏明 | FC歧阜 | 12 | 2 |
| 14 | 佐藤洸一 | 长崎成功丸 | 12 | 3 |
| 15 | 押谷祐树 | 冈山绿雉 | 11 | 1 |
| 15 | 吉田真纪人 | 水户蜀葵 | 11 | 1 |
| 17 | 西田刚 | FC爱媛 | 10 | 0 |
| 18 | 森本贵幸 | 千叶市原 | 10 | 1 |
| 19 | 城后寿 | 福冈黄蜂 | 9 | 0 |
| 19 | 金森健志 | 福冈黄蜂 | 9 | 0 |
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