| 排名 | 球员 | 球队 | 进球数 | 点球数 |
| 1 | 香川真司 | 大阪樱花 | 27 | 3 |
| 2 | 都仓贤 | 草津温泉 | 23 | 2 |
| 3 | 大黑将志 | 东京日视 | 21 | 1 |
| 4 | 干贵士 | 大阪樱花 | 20 | 0 |
| 5 | 蒂亚戈.奎里诺 | 札幌康萨多尔 | 19 | 1 |
| 6 | 马拉纳奥 | 甲府疾风 | 19 | 3 |
| 6 | 高崎寬之 | 水户蜀葵 | 19 | 3 |
| 8 | 内村圭宏 | FC爱媛 | 18 | 2 |
| 9 | 大久保哲哉 | 福冈黄蜂 | 16 | 0 |
| 9 | 马塞洛.苏亚雷斯 | 仙台维加泰 | 16 | 0 |
| 11 | 佐藤洸一 | FC岐阜 | 16 | 2 |
| 12 | 夏维拿亚 | 鸟栖沙岩 | 15 | 0 |
| 13 | 金信泳 | 甲府疾风 | 14 | 0 |
| 13 | 荒田智之 | 水户蜀葵 | 14 | 0 |
| 13 | 中村佑也 | 湘南比马 | 14 | 0 |
| 16 | 梁勇基 | 仙台维加泰 | 14 | 1 |
| 17 | 阪本紘司 | 湘南比马 | 13 | 0 |
| 18 | 河原和寿 | 枥木SC | 13 | 1 |
| 19 | 德重隆明 | 德岛漩涡 | 13 | 2 |
| 20 | 羽地登志晃 | 德岛漩涡 | 12 | 0 |
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